Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX39BQ13838 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DDX39BQ13838 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DDX39BQ13838 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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