Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALCAMQ13740 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALCAMQ13740 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALCAMQ13740 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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