Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGA7Q13683 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGA7Q13683 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms