Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPBGQ13641 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TPBGQ13641 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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