Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CUL4BQ13620 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CUL4BQ13620 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CUL4BQ13620 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
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