Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKP2Q13309 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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SKP2Q13309 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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SKP2Q13309 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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SKP2Q13309 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SKP2Q13309 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SKP2Q13309 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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