Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC39.55■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
PRDM2Q13029 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC39.51■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PRDM2Q13029 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
PRDM2Q13029 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
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