Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YKR041WYKR041W 753 nt5.82□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt5.82□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YJR124CYJR124C 1347 nt5.81□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 SEC9YGR009C 1956 nt5.81□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 NQM1YGR043C 1002 nt5.81□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt5.81□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.81□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YLR169WYLR169W 354 nt5.81□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 MRPL4YLR439W 960 nt5.81□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 CKB2YOR039W 777 nt5.81□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 TOM5YPR133W-A 153 nt5.81□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 SSZ1YHR064C 1617 nt5.81□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 HPF1YOL155C 2904 nt5.81□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 TUB2YFL037W 1374 nt5.8□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 PXA1YPL147W 2613 nt5.8□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 SDA1YGR245C 2304 nt5.8□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 VTC2YFL004W 2487 nt5.8□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 IPI3YNL182C 1668 nt5.8□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 ERD1YDR414C 1089 nt5.8□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 PCL1YNL289W 840 nt5.8□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YNL296WYNL296W 315 nt5.8□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 VHS2YIL135C 1311 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YFL034WYFL034W 3222 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 GCS1YDL226C 1059 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YDR053WYDR053W 396 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 SNM1YDR478W 597 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YGL101WYGL101W 648 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YIL086CYIL086C 309 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 RPA49YNL248C 1248 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YPL113CYPL113C 1191 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 ASK10YGR097W 3441 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 MSH1YHR120W 2880 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 ARN1YHL040C 1884 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 DHH1YDL160C 1521 nt5.79□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 ATG20YDL113C 1923 nt5.78□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 MBP1YDL056W 2502 nt5.78□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 TRP4YDR354W 1143 nt5.78□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 SPO16YHR153C 597 nt5.78□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.78□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt5.78□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YMR010WYMR010W 1218 nt5.78□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 YNR042WYNR042W 429 nt5.78□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 SSP2YOR242C 1116 nt5.78□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 HPC2YBR215W 1878 nt5.78□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 MAD3YJL013C 1548 nt5.78□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 VHS1YDR247W 1386 nt5.78□□□□□ -1.48
CLF1Q12309 RPT4YOR259C 1314 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 RPN12YFR052W 825 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 ERG26YGL001C 1050 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 SKI8YGL213C 1194 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 CAX4YGR036C 720 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 OKP1YGR179C 1221 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 RPB4YJL140W 666 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 YLR346CYLR346C 306 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 MRPS8YMR158W 468 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 NOP13YNL175C 1212 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 IRC14YOR135C 342 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 PDC1YLR044C 1692 nt5.77□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 GDB1YPR184W 4611 nt5.76□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 DXO1YDR370C 1329 nt5.76□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 ARO2YGL148W 1131 nt5.76□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 NAG1YGR031C-A 492 nt5.76□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 WSS1YHR134W 810 nt5.76□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.76□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 SPS18YNL204C 903 nt5.76□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 STE50YCL032W 1041 nt5.76□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 YOR1YGR281W 4434 nt5.76□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 GSH2YOL049W 1476 nt5.76□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 UBP7YIL156W 3216 nt5.76□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 YTA12YMR089C 2478 nt5.75□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 YDL121CYDL121C 450 nt5.75□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 GCV1YDR019C 1203 nt5.75□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 DIN7YDR263C 1293 nt5.75□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 MPS2YGL075C 1164 nt5.75□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 SPG4YMR107W 348 nt5.75□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 MDY2YOL111C 639 nt5.75□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 OCA5YHL029C 2040 nt5.75□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 UGA1YGR019W 1416 nt5.74□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 ADH4YGL256W 1149 nt5.74□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 YBL029WYBL029W 1131 nt5.74□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 RSF1YMR030W 1131 nt5.74□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 CBP1YJL209W 1965 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 SIS2YKR072C 1689 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 IWR1YDL115C 1062 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 MNN10YDR245W 1182 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 TCA17YEL048C 459 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 YGR011WYGR011W 327 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 PUS6YGR169C 1215 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 YLL047WYLL047W 384 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 BLS1YLR408C 369 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 ERV41YML067C 1059 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 YOR024WYOR024W 324 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 RPL21BYPL079W 483 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 YPR109WYPR109W 885 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 YSA1YBR111C 696 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 MEC3YLR288C 1425 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 ZUO1YGR285C 1302 nt5.73□□□□□ -1.49
CLF1Q12309 COT1YOR316C 1320 nt5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.5 ms