Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 ICY2YPL250C 411 nt5.16□□□□□ -1.58
TY3A-GQ12173 SAP155YFR040W 3009 nt5.16□□□□□ -1.58
TY3A-GQ12173 HES1YOR237W 1305 nt5.16□□□□□ -1.58
TY3A-GQ12173 ATG23YLR431C 1362 nt5.16□□□□□ -1.58
TY3A-GQ12173 UGA1YGR019W 1416 nt5.15□□□□□ -1.58
TY3A-GQ12173 CAF4YKR036C 1932 nt5.15□□□□□ -1.58
TY3A-GQ12173 IMA1YGR287C 1770 nt5.15□□□□□ -1.58
TY3A-GQ12173 RSM10YDR041W 612 nt5.15□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 RML2YEL050C 1182 nt5.15□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 YGL185CYGL185C 1140 nt5.15□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 YJL107CYJL107C 1164 nt5.15□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.15□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 XPT1YJR133W 630 nt5.15□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 CSR1YLR380W 1227 nt5.15□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 ZPS1YOL154W 750 nt5.15□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 STE20YHL007C 2820 nt5.15□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 CYK3YDL117W 2658 nt5.15□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 HPC2YBR215W 1878 nt5.15□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 SLT2YHR030C 1455 nt5.14□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 SYG1YIL047C 2709 nt5.14□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 LYP1YNL268W 1836 nt5.14□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 KRE28YDR532C 1158 nt5.14□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 YGL152CYGL152C 678 nt5.14□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 YHR095WYHR095W 495 nt5.14□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 RFC2YJR068W 1062 nt5.14□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 UBI4YLL039C 1146 nt5.14□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 MID2YLR332W 1131 nt5.14□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 DAK1YML070W 1755 nt5.14□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 YMR102CYMR102C 2505 nt5.14□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 APM4YOL062C 1476 nt5.13□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 RAD30YDR419W 1899 nt5.13□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 MCX1YBR227C 1563 nt5.13□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 REV7YIL139C 738 nt5.13□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 YLR346CYLR346C 306 nt5.13□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 VHS2YIL135C 1311 nt5.13□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 NPL6YMR091C 1308 nt5.13□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 GSY1YFR015C 2127 nt5.12□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 YFT2YDR319C 825 nt5.12□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 DBP8YHR169W 1296 nt5.12□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 MDY2YOL111C 639 nt5.12□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 ELP2YGR200C 2367 nt5.11□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 YJR085CYJR085C 318 nt5.11□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 RPL15BYMR121C 615 nt5.11□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 CTS1YLR286C 1689 nt5.11□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 APC4YDR118W 1959 nt5.1□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 PEX7YDR142C 1128 nt5.1□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 TRX2YGR209C 315 nt5.1□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 MAL13YGR288W 1422 nt5.1□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 ECM1YAL059W 639 nt5.1□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 BUD22YMR014W 1560 nt5.1□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 ADD37YMR184W 597 nt5.1□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 BUB3YOR026W 1026 nt5.1□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 PRO2YOR323C 1371 nt5.1□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 RPL19AYBR084C-A 570 nt5.1□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 CPS1YJL172W 1731 nt5.09□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 CBF5YLR175W 1452 nt5.09□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 UBC8YEL012W 657 nt5.09□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 GRX4YER174C 735 nt5.09□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 GSP2YOR185C 663 nt5.09□□□□□ -1.59
TY3A-GQ12173 SEC9YGR009C 1956 nt5.09□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 KRS1YDR037W 1776 nt5.09□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 KRE9YJL174W 831 nt5.08□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 YJL211CYJL211C 444 nt5.08□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 GMC1YDR506C 1827 nt5.08□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 ATR1YML116W 1629 nt5.08□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 PXA1YPL147W 2613 nt5.07□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 PIC2YER053C 903 nt5.07□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 YER187WYER187W 426 nt5.07□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 STE12YHR084W 2067 nt5.06□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 FPK1YNR047W 2682 nt5.06□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 YGR122WYGR122W 1209 nt5.06□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 SLZ1YNL196C 897 nt5.06□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 RER1YCL001W 567 nt5.06□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 UBA2YDR390C 1911 nt5.05□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 YDL012CYDL012C 324 nt5.05□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 PEX19YDL065C 1029 nt5.05□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 TRS23YDR246W 660 nt5.05□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt5.05□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 CTR3YLR411W 726 nt5.05□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 YMR245WYMR245W 621 nt5.05□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 snR10snR10 245 nt5.05□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 SNF8YPL002C 702 nt5.05□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 ABF1YKL112W 2196 nt5.05□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 SIS2YKR072C 1689 nt5.05□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 GDH2YDL215C 3279 nt5.05□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 HXT14YNL318C 1623 nt5.05□□□□□ -1.6
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TY3A-GQ12173 BRE2YLR015W 1518 nt5.04□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 CPR4YCR069W 957 nt5.04□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 GLE2YER107C 1098 nt5.04□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 SUT1YGL162W 900 nt5.04□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 YGR066CYGR066C 879 nt5.04□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 GTO1YGR154C 1071 nt5.04□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 RPS4BYHR203C 786 nt5.04□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 RPS4AYJR145C 786 nt5.04□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 EXO1YOR033C 2109 nt5.04□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 ECM33YBR078W 1290 nt5.04□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 SAP4YGL229C 2457 nt5.04□□□□□ -1.6
TY3A-GQ12173 PTR2YKR093W 1806 nt5.04□□□□□ -1.6
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