Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
APOBRQ0VD83 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
APOBRQ0VD83 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APOBRQ0VD83 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms