Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FAM27E3Q08E93 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM27E3Q08E93 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM27E3Q08E93 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms