Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C2orf54Q08AI8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C2orf54Q08AI8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C2orf54Q08AI8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms