Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A11Q08AI6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A11Q08AI6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms