Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE4DQ08499 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE4DQ08499 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDE4DQ08499 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms