Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CACNB2Q08289 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNB2Q08289 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms