Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DHX9Q08211 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DHX9Q08211 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DHX9Q08211 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms