Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLEQ07864 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLEQ07864 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLEQ07864 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLEQ07864 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLEQ07864 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLEQ07864 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLEQ07864 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLEQ07864 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLEQ07864 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLEQ07864 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLEQ07864 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLEQ07864 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLEQ07864 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLEQ07864 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLEQ07864 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLEQ07864 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLEQ07864 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLEQ07864 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLEQ07864 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLEQ07864 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLEQ07864 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLEQ07864 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLEQ07864 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLEQ07864 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLEQ07864 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLEQ07864 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLEQ07864 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLEQ07864 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLEQ07864 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLEQ07864 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLEQ07864 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLEQ07864 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLEQ07864 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLEQ07864 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
POLEQ07864 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLEQ07864 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLEQ07864 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLEQ07864 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLEQ07864 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLEQ07864 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLEQ07864 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLEQ07864 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLEQ07864 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLEQ07864 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLEQ07864 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLEQ07864 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLEQ07864 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLEQ07864 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLEQ07864 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLEQ07864 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLEQ07864 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLEQ07864 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLEQ07864 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLEQ07864 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLEQ07864 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLEQ07864 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLEQ07864 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLEQ07864 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLEQ07864 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLEQ07864 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLEQ07864 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
POLEQ07864 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms