Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RING1Q06587 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RING1Q06587 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RING1Q06587 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RING1Q06587 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RING1Q06587 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RING1Q06587 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RING1Q06587 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RING1Q06587 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RING1Q06587 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RING1Q06587 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RING1Q06587 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RING1Q06587 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RING1Q06587 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RING1Q06587 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RING1Q06587 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RING1Q06587 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RING1Q06587 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RING1Q06587 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RING1Q06587 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RING1Q06587 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RING1Q06587 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RING1Q06587 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RING1Q06587 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RING1Q06587 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RING1Q06587 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RING1Q06587 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RING1Q06587 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RING1Q06587 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RING1Q06587 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RING1Q06587 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RING1Q06587 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RING1Q06587 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RING1Q06587 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RING1Q06587 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RING1Q06587 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RING1Q06587 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RING1Q06587 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RING1Q06587 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RING1Q06587 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RING1Q06587 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RING1Q06587 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RING1Q06587 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RING1Q06587 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RING1Q06587 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RING1Q06587 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RING1Q06587 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RING1Q06587 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RING1Q06587 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RING1Q06587 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RING1Q06587 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RING1Q06587 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RING1Q06587 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RING1Q06587 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RING1Q06587 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RING1Q06587 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RING1Q06587 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RING1Q06587 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RING1Q06587 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RING1Q06587 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RING1Q06587 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RING1Q06587 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RING1Q06587 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RING1Q06587 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RING1Q06587 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RING1Q06587 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RING1Q06587 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RING1Q06587 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RING1Q06587 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RING1Q06587 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RING1Q06587 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RING1Q06587 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RING1Q06587 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RING1Q06587 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RING1Q06587 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RING1Q06587 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RING1Q06587 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RING1Q06587 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RING1Q06587 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
RING1Q06587 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RING1Q06587 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RING1Q06587 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RING1Q06587 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RING1Q06587 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RING1Q06587 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RING1Q06587 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RING1Q06587 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RING1Q06587 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms