Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GABPAQ06546 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GABPAQ06546 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABPAQ06546 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms