Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	PXA1	YPL147W	2613 nt		5.48	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	HOF1	YMR032W	2010 nt		5.48	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	SWI3	YJL176C	2478 nt		5.47	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	IPK1	YDR315C	846 nt		5.47	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	RPL12A	YEL054C	498 nt		5.47	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	SPC42	YKL042W	1092 nt		5.47	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	ROT2	YBR229C	2865 nt		5.47	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	MPP10	YJR002W	1782 nt		5.47	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	BUD22	YMR014W	1560 nt		5.46	□□□□□ -1.53
MRD1	Q06106	FRE7	YOL152W	1863 nt		5.46	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	ADE6	YGR061C	4077 nt		5.46	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	YDR417C	YDR417C	372 nt		5.45	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	YJR012C	YJR012C	624 nt		5.45	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	YAR019W-A	YAR019W-A	333 nt		5.45	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	YTA6	YPL074W	2265 nt		5.45	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	FAP1	YNL023C	2898 nt		5.45	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	RSC6	YCR052W	1452 nt		5.45	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	RRP3	YHR065C	1506 nt		5.44	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	HST4	YDR191W	1113 nt		5.44	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	SPT3	YDR392W	1014 nt		5.44	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	RPL28	YGL103W	450 nt		5.44	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	OSW5	YMR148W	447 nt		5.44	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	ADD37	YMR184W	597 nt		5.44	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	snR10	snR10	245 nt		5.44	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	TRS33	YOR115C	807 nt		5.44	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	YDR132C	YDR132C	1488 nt		5.44	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	PSY4	YBL046W	1326 nt		5.44	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	APL6	YGR261C	2430 nt		5.44	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	STE7	YDL159W	1548 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	SAF1	YBR280C	1914 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	CCS1	YMR038C	750 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	QCR2	YPR191W	1107 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	GMC1	YDR506C	1827 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	GCN20	YFR009W	2259 nt		5.43	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	PRP43	YGL120C	2304 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	UGA1	YGR019W	1416 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	MHF2	YDL160C-A	243 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	MRPL25	YGR076C	474 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	UBX7	YBR273C	1311 nt		5.42	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	SUM1	YDR310C	3189 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	LCB2	YDR062W	1686 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	FUM1	YPL262W	1467 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	YGR153W	YGR153W	654 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	HLJ1	YMR161W	675 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	YBR126W-A	YBR126W-A	207 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	PRT1	YOR361C	2292 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	FAA4	YMR246W	2085 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	RAD30	YDR419W	1899 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	SLD2	YKL108W	1362 nt		5.41	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	MUM3	YOR298W	1440 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	PCL6	YER059W	1263 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	TYW3	YGL050W	822 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	SPO12	YHR152W	522 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	YOL035C	YOL035C	303 nt		5.4	□□□□□ -1.54
MRD1	Q06106	EMP46	YLR080W	1335 nt		5.4	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	YMD8	YML038C	1329 nt		5.4	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	ATR1	YML116W	1629 nt		5.4	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	MSC7	YHR039C	1935 nt		5.4	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	MBP1	YDL056W	2502 nt		5.4	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	GPR1	YDL035C	2886 nt		5.4	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	PHO90	YJL198W	2646 nt		5.4	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	LAP2	YNL045W	2016 nt		5.4	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	GAS3	YMR215W	1575 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	SIF2	YBR103W	1608 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	ASP1	YDR321W	1146 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	GRE1	YPL223C	507 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	ATG14	YBR128C	1035 nt		5.39	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	IMD3	YLR432W	1572 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	ATG1	YGL180W	2694 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	YER187W	YER187W	426 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	RPL43B	YJR094W-A	279 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	SAP30	YMR263W	606 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	RPC19	YNL113W	429 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	SEG2	YKL105C	3399 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	VHS2	YIL135C	1311 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	YMR111C	YMR111C	1389 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	MRE11	YMR224C	2079 nt		5.38	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	DAL81	YIR023W	2913 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	SYP1	YCR030C	2613 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	APC4	YDR118W	1959 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	STE12	YHR084W	2067 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	RPS16B	YDL083C	432 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	ARF2	YDL137W	546 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	AAD6	YFL056C	639 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	NMA1	YLR328W	1206 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	YBL006W-A	YBL006W-A	150 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	MAC1	YMR021C	1254 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	APE1	YKL103C	1545 nt		5.37	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	TOM40	YMR203W	1164 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	YNL134C	YNL134C	1131 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	PAL1	YDR348C	1500 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	YEH2	YLR020C	1617 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	CPS1	YJL172W	1731 nt		5.36	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	MAG2	YLR427W	2013 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	MID2	YLR332W	1131 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	SLZ1	YNL196C	897 nt		5.35	□□□□□ -1.55
MRD1	Q06106	SOL1	YNR034W	966 nt		5.35	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.5 ms