Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNB3Q05901 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNB3Q05901 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms