Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRIN1Q05586 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRIN1Q05586 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRIN1Q05586 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms