Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNFAIP2Q03169 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFAIP2Q03169 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFAIP2Q03169 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms