Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR3Q03167 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TGFBR3Q03167 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TGFBR3Q03167 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms