Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAX5Q02548 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAX5Q02548 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAX5Q02548 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms