Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSC2Q02487 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DSC2Q02487 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms