Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PLCB3Q01970 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLCB3Q01970 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms