Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC6A3Q01959 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC6A3Q01959 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC6A3Q01959 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms