Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BEX3Q00994 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BEX3Q00994 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BEX3Q00994 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms