Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MDM2Q00987 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MDM2Q00987 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms