Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDKL1Q00532 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms