Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPCAP84074 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HPCAP84074 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HPCAP84074 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HPCAP84074 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HPCAP84074 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HPCAP84074 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPCAP84074 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HPCAP84074 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPCAP84074 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPCAP84074 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPCAP84074 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPCAP84074 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPCAP84074 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPCAP84074 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPCAP84074 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAP84074 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAP84074 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAP84074 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAP84074 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAP84074 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPCAP84074 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAP84074 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAP84074 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAP84074 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAP84074 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAP84074 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAP84074 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAP84074 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAP84074 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAP84074 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAP84074 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAP84074 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPCAP84074 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAP84074 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAP84074 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAP84074 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAP84074 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAP84074 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAP84074 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAP84074 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPCAP84074 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAP84074 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAP84074 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAP84074 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAP84074 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAP84074 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAP84074 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAP84074 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAP84074 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAP84074 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAP84074 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAP84074 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPCAP84074 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAP84074 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAP84074 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAP84074 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAP84074 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAP84074 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAP84074 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAP84074 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAP84074 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HPCAP84074 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPCAP84074 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPCAP84074 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPCAP84074 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPCAP84074 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPCAP84074 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPCAP84074 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HPCAP84074 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HPCAP84074 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPCAP84074 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPCAP84074 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HPCAP84074 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HPCAP84074 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPCAP84074 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPCAP84074 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPCAP84074 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPCAP84074 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPCAP84074 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPCAP84074 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPCAP84074 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HPCAP84074 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HPCAP84074 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms