Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA4P83105 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA4P83105 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA4P83105 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms