Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPL23AP62750 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms