Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PSMC6P62333 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSMC6P62333 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSMC6P62333 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms