Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2HP62256 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2HP62256 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBE2HP62256 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms