Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMC1P62191 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMC1P62191 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms