Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NCS1P62166 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCS1P62166 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCS1P62166 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCS1P62166 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCS1P62166 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCS1P62166 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCS1P62166 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCS1P62166 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NCS1P62166 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCS1P62166 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCS1P62166 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCS1P62166 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCS1P62166 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NCS1P62166 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCS1P62166 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCS1P62166 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCS1P62166 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCS1P62166 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NCS1P62166 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCS1P62166 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCS1P62166 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCS1P62166 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCS1P62166 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCS1P62166 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCS1P62166 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCS1P62166 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCS1P62166 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCS1P62166 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCS1P62166 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCS1P62166 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCS1P62166 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCS1P62166 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NCS1P62166 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NCS1P62166 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCS1P62166 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCS1P62166 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCS1P62166 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCS1P62166 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCS1P62166 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCS1P62166 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCS1P62166 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCS1P62166 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCS1P62166 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCS1P62166 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCS1P62166 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCS1P62166 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCS1P62166 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCS1P62166 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCS1P62166 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCS1P62166 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCS1P62166 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCS1P62166 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCS1P62166 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCS1P62166 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCS1P62166 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCS1P62166 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCS1P62166 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms