Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFM1P61960 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFM1P61960 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFM1P61960 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UFM1P61960 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFM1P61960 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFM1P61960 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UFM1P61960 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFM1P61960 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UFM1P61960 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFM1P61960 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFM1P61960 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UFM1P61960 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UFM1P61960 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFM1P61960 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFM1P61960 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFM1P61960 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFM1P61960 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UFM1P61960 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFM1P61960 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFM1P61960 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFM1P61960 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFM1P61960 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFM1P61960 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UFM1P61960 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFM1P61960 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFM1P61960 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFM1P61960 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFM1P61960 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFM1P61960 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFM1P61960 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UFM1P61960 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFM1P61960 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UFM1P61960 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFM1P61960 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UFM1P61960 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
UFM1P61960 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UFM1P61960 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UFM1P61960 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFM1P61960 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFM1P61960 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFM1P61960 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFM1P61960 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFM1P61960 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFM1P61960 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFM1P61960 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UFM1P61960 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UFM1P61960 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFM1P61960 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFM1P61960 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFM1P61960 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFM1P61960 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFM1P61960 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFM1P61960 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFM1P61960 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFM1P61960 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFM1P61960 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UFM1P61960 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFM1P61960 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFM1P61960 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFM1P61960 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFM1P61960 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFM1P61960 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFM1P61960 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFM1P61960 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFM1P61960 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFM1P61960 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFM1P61960 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UFM1P61960 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UFM1P61960 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms