Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VBP1P61758 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VBP1P61758 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VBP1P61758 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VBP1P61758 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VBP1P61758 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VBP1P61758 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VBP1P61758 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VBP1P61758 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VBP1P61758 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VBP1P61758 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VBP1P61758 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VBP1P61758 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VBP1P61758 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VBP1P61758 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VBP1P61758 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VBP1P61758 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VBP1P61758 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VBP1P61758 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VBP1P61758 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VBP1P61758 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VBP1P61758 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VBP1P61758 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VBP1P61758 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VBP1P61758 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VBP1P61758 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VBP1P61758 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VBP1P61758 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VBP1P61758 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VBP1P61758 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VBP1P61758 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VBP1P61758 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VBP1P61758 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VBP1P61758 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VBP1P61758 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VBP1P61758 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VBP1P61758 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VBP1P61758 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VBP1P61758 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VBP1P61758 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VBP1P61758 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VBP1P61758 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VBP1P61758 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VBP1P61758 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VBP1P61758 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VBP1P61758 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VBP1P61758 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VBP1P61758 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VBP1P61758 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VBP1P61758 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VBP1P61758 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VBP1P61758 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VBP1P61758 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VBP1P61758 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VBP1P61758 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VBP1P61758 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VBP1P61758 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VBP1P61758 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VBP1P61758 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VBP1P61758 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VBP1P61758 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VBP1P61758 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VBP1P61758 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VBP1P61758 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VBP1P61758 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VBP1P61758 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VBP1P61758 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VBP1P61758 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VBP1P61758 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VBP1P61758 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VBP1P61758 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VBP1P61758 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VBP1P61758 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VBP1P61758 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VBP1P61758 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VBP1P61758 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VBP1P61758 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VBP1P61758 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VBP1P61758 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VBP1P61758 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VBP1P61758 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VBP1P61758 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VBP1P61758 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VBP1P61758 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VBP1P61758 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VBP1P61758 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms