Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSME3P61289 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME3P61289 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME3P61289 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME3P61289 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME3P61289 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME3P61289 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME3P61289 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSME3P61289 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME3P61289 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME3P61289 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME3P61289 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME3P61289 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME3P61289 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME3P61289 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME3P61289 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME3P61289 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME3P61289 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME3P61289 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME3P61289 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSME3P61289 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME3P61289 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME3P61289 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME3P61289 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME3P61289 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME3P61289 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME3P61289 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME3P61289 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME3P61289 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME3P61289 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME3P61289 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME3P61289 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSME3P61289 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSME3P61289 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSME3P61289 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSME3P61289 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSME3P61289 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PSME3P61289 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PSME3P61289 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME3P61289 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME3P61289 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME3P61289 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME3P61289 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME3P61289 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME3P61289 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME3P61289 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME3P61289 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME3P61289 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME3P61289 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME3P61289 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME3P61289 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME3P61289 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME3P61289 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME3P61289 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME3P61289 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms