Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CTXN1P60606 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTXN1P60606 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms