Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
KRTAP12-1P59990 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
KRTAP12-1P59990 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms