Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MCCD1P59942 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCCD1P59942 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCCD1P59942 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms