Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A3P57103 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC8A3P57103 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC8A3P57103 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms