Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLDN8P56748 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms