Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL23P55773 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL23P55773 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL23P55773 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL23P55773 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL23P55773 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL23P55773 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL23P55773 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCL23P55773 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCL23P55773 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL23P55773 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL23P55773 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL23P55773 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL23P55773 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL23P55773 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL23P55773 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL23P55773 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL23P55773 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL23P55773 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL23P55773 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL23P55773 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCL23P55773 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCL23P55773 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL23P55773 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL23P55773 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL23P55773 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL23P55773 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL23P55773 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL23P55773 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL23P55773 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL23P55773 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL23P55773 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCL23P55773 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCL23P55773 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL23P55773 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL23P55773 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL23P55773 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL23P55773 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL23P55773 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL23P55773 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL23P55773 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL23P55773 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL23P55773 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCL23P55773 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL23P55773 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL23P55773 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL23P55773 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL23P55773 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL23P55773 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL23P55773 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCL23P55773 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms