Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIM2P55344 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIM2P55344 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIM2P55344 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIM2P55344 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIM2P55344 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIM2P55344 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LIM2P55344 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIM2P55344 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIM2P55344 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIM2P55344 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIM2P55344 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIM2P55344 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIM2P55344 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIM2P55344 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIM2P55344 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIM2P55344 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIM2P55344 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIM2P55344 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIM2P55344 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIM2P55344 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIM2P55344 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIM2P55344 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LIM2P55344 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIM2P55344 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIM2P55344 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIM2P55344 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIM2P55344 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIM2P55344 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIM2P55344 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIM2P55344 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIM2P55344 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIM2P55344 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIM2P55344 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIM2P55344 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIM2P55344 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIM2P55344 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LIM2P55344 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIM2P55344 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIM2P55344 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIM2P55344 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LIM2P55344 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIM2P55344 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIM2P55344 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIM2P55344 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIM2P55344 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIM2P55344 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIM2P55344 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIM2P55344 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIM2P55344 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIM2P55344 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIM2P55344 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms