Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRPF1P55201 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRPF1P55201 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms