Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC12A3P55017 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms